Plusieurs architectes ont participé à la reconstruction du palais à la suite des deux tremblements de terre de 1693 et 1818. La façade du palais est l'œuvre de l'architecte Mario Di Stefano, qui abrite également un magnifique cloître conçu par Vaccarini. L'aula magna, quant à elle, est d'une grande importance avec ses plafonds ornés de fresques réalisées par le catanais Giovan Battista Piparo, tandis que les murs sont revêtus d'un tissu rouge damassé, sur l'un desquels se distingue une imposante tapisserie arborant les armoiries aragonaises. Il convient également de mentionner le patrimoine conservé par l'université, qui compte environ 200 000 ouvrages, manuscrits et codes.